Software

Die von uns entwickelte Open-Source Software steht auf auf unserer GitHub-Seite zum Herunterladen zur Verfügung. 

Meistbenutzte Software:

HH-suite for sensitive protein sequence searching using hidden Markov models

MMseqs2 ultra fast and sensitive sequence searching and clustering: https://mmseqs.com

Datenbanken fuer MMseqs2 software: https:/data.mmseqs.com

CCMpred: protein residue-residue Contacts from Correlated Mutations

WiSH: Who is the host? prediction of phage-host relationships

Webserver:

Einige unserer Tools sind als Webservice verfügbar im MPI Bioinformatics Toolkit unserer Tübinger Kollegen.

MMseqs2 server for fast sequence similarity search: https://search.mmseqs.com/search

BaMMmotif2 webserver for motif discovery and analysis in DNA and RNA sequences: https://bammmotif.soedinglab.org

Datenserver (für HH-suite etc): Data-Server