Facility für Data Sciences und Biostatistik

Die Core Facility Data Sciences und Biostatistik bietet Unterstützung in Datenanalyse für Proteogenomics, klassische Bioinformatik, Modellierung und Biostatistik.

 

1. Proteogenomics:

• Transkriptomics:
  RNA-Sequenzierungsdatenanalyse, Transkriptom-Quantifizierung, de novo Transkriptom-Assemblierung, differentielle Genexpression
• Proteomik und Peptidomics:
  Massenspektrometrie (MS) Datenanalyse, Identifizierung und Quantifizierung von Proteomen, differentielle Protein-Expression, Proteinsequenzanalyse (Anreicherung und Annotation)
• Proteogenomics:
  Integration von Proteomik- und Transkriptomics-Daten zur Identifizierung neuer Transkripte

2. Klassische Bioinformatik:

• Overrepresentation / Enrichment Analyse, Sequenz- und Motif-Analyse, ML (z. B. Klassifikatoren)

3. Modellierung:

• Kinetische/mechanistische/statistische Modellierung, deterministische und stochastische Modellierung, Bayessche Inferenz und Modellselektionsansätze, klassische maschinelle Lern- und Deep-Learning-Ansätze, Klassifikatoren/Vorhersagemodelle

4. Biostatistik:

• Unterstützung bei allgemeinen statistischen Fragen, Statistik für Datenanalyse, biometrische Stichprobengrößenberechnung